Ich möchte meine bestehende TURBOVEG-Datenbank auf die GermanSL umstellen. Was muss ich tun?
Fall A: Bisherige Referenzliste ohne bekannte Beziehung zur GermanSL
Das R-Paket vegdata besitzt Funktionen, um die Schreibweise von Namen zu harmonsieren (taxname.abbr) oder auch in gewissem Rahmen Schreibfehler und Schreibvarianten zu berücksichtigen (taxname.simplify). Damit können Namen verglichen werden. Eine Liste möglicher Unterschiede beim Umfang der Taxa werden über die Funktion taxval ausgegeben.
Wenn es sich um eine Turboveg-datenbank handelt, die Datenbank ins Standard-XML Format zu exportieren und anschließend (GermanSL muss sich schon im Ordner Turboveg/Species befinden) in eine neue Datenbank zu reimportieren. Dabei die GermanSL als Zielreferenzliste auswählen. Nun werden alle gleichlautenden Namen gematcht und alle nicht vollständig übereinstimmenden Namen in einer Liste angezeigt, in der sie nun manuell zugeordnet werden können.
Anmerkungen:
a) Es muss die Namensschreibweise an die orthografischen Konventionen der GermanSL angeglichen werden, etwa die Abkürzung von Unterarten („subsp.“) und von Artengruppen mit „agg.“. Wenn sich die Abkürzungen unterscheiden, ist es sinnvoll, den XML-File in einem Text-Editor (z.B. Wordpad) zu öffnen und mit Hilfe von Suchen und Ersetzen dieselben anzupassen.
b.) Meist ist es sinnvoll, den Import in mehreren Schritten zu bewerkstelligen. Erstes Ausprobieren, Manipulation der Taxonnamen im Texteditor, zwiter Versuch, …
c) Im Falle von „Homonymen“ muss der Benutzer vorher entscheiden, in welchem Sinne sie in seiner eigenen Datenbank verwendet wurden und dies dann ggf. durch Hinzufügungen zum Namen wie „s. str.“ kenntlich machen. Wir werden auf der Sektions-Homepage eine Liste von Sippennamen bereitstellen, bei denen man besonders auf mögliche „Homonymien“ achten muss.
TURBOVEG bietet ferner Importfunktionen für Vegetationsdaten aus zahlreichen anderen Formaten für die “Taxon-Matching” ähnlich funktioniert.
Fall B: Upgrade einer GermanSL-Datenbank
Durch die Sicherstellung der Integrität zwischen Taxonnummer und Potential Taxon (Behrendsohn 1995) ist ein vereinfachter Wechsel möglich.
Im README zu jeder neuen Version werden die Unterschiede zur Vorversion erläutert.
Mögliche Probleme:
gelöschte Nummern: Für die Pflege der GermanSL ist es essentiell, dass immer mal wieder Taxa gelöscht werden, bei denen sich herausgestellt hat, dass es sich um Dopplungen oder nicht in Deutschland vorkommende Sippen handelt. Sofern diese nicht als Synonyme oder mit dem Zusatz "depr." weitergeführt werden, kann es vorkommen, dass ihre Daten nicht mehr referenziert werden können und die entsprechenden Nummern umgesetzt werden müssen. Für die Wechesle zwischen den GSL Versionen 1.0 bis 1.4.5 handelt es sich stets nur um wenige Nummern. Es ist sichergestellt, dass gelöschte Nummern niemals für neue Taxa verwendet werden.
In Turboveg Datenbank öffnen und unter Select -> Build Query -> Species Data -> ANd/Or auswählen. Unten rechts gibt es einen Button “Load”, mit dem die lostnr.dbf geladen werden kann. Wenn nach Save und Execute keine Aufnahmen mit diesen Arten gefunden werden, kann es weiter gehen. Ansonsten bitte in Handarbeit die kritischen Sippennamen anpassen.
Als nächstes werden eventuelle Taxa mit neuer Taxonnummer umgesetzt: Unter Edit -> Replace Species die Datei newnr.dbf auswählen und auf Replace klicken.
Nun können z.B. durch einen Klick auf das lila Feld rechts unten die Datenbankattribute aufgerufen werden und die neue Species List ausgewählt werden.